薄层色谱仪可检测所有有机化合物尤其是气相色谱不易分离、液相色谱难以分析的有机化合物及药物中大分子化合物、跟踪有机合成反应过程。可在开放的条件下检测气相色谱和液相色谱方法很难检测的复杂样品，并可以非常简单的对所分析的样品进行定量。
色谱仪是采用棒状薄层分离技术与氢火焰离子化检测 (TLC/FID) 手段组合而成的高精密科学分析仪器。 主要应用以下研究中：脂类、磷脂类、蜡、脂肪酸、合成脂和合成油、润滑脂、润滑油类、表面活性剂、各类工业脂类、原油、沥青、渣油和各类烃类物质、聚合物，食用油，医药试剂。
薄层色谱仪的特点:
操作简便：可直接获得薄层色谱，不需在展开后进行区域的加色或划分；
应用广泛：对于大量的有机化合物都能直接检测，包括很难用于气相色谱分析的较高沸点样品；
定量方便：可计算每个分析样品的平均值和相对应的峰的位置，打印结果；
更加环保：由于使用有机溶剂的用量极少，大大降低了对人体的损害，有利环保。
更加高效：一次操作可分别检测十根色谱棒，每个样品所需时间仅为30秒，一天多可检测6组60个样品；
薄层色谱仪的工作原理:
将常温下不挥发、在火焰中燃烧可溶性的有机样品，用溶剂稀释后点到涂有硅胶氧化铝吸附的薄层棒上，除溶剂后放入相应的展开槽中，在一定的饱和蒸气压的环境条件下进行展开分离；经过样品展开后的薄层棒按顺序进入到FID中，按一定速度在FID上燃烧；得到离子流信号由计算机采集处理；从而得到色谱分析结果。
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